Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf280dQ68FE8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf280dQ68FE8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf280dQ68FE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf280dQ68FE8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf280dQ68FE8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf280dQ68FE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf280dQ68FE8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Znf280dQ68FE8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Znf280dQ68FE8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Znf280dQ68FE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Znf280dQ68FE8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf280dQ68FE8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf280dQ68FE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf280dQ68FE8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Znf280dQ68FE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Znf280dQ68FE8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Znf280dQ68FE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Znf280dQ68FE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Znf280dQ68FE8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Znf280dQ68FE8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf280dQ68FE8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf280dQ68FE8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf280dQ68FE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf280dQ68FE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf280dQ68FE8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf280dQ68FE8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Znf280dQ68FE8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Znf280dQ68FE8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Znf280dQ68FE8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf280dQ68FE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf280dQ68FE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf280dQ68FE8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf280dQ68FE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf280dQ68FE8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf280dQ68FE8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Znf280dQ68FE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Znf280dQ68FE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Znf280dQ68FE8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf280dQ68FE8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf280dQ68FE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf280dQ68FE8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf280dQ68FE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf280dQ68FE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf280dQ68FE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf280dQ68FE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf280dQ68FE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf280dQ68FE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf280dQ68FE8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf280dQ68FE8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms