Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sbno1Q689Z5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Sbno1Q689Z5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Sbno1Q689Z5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sbno1Q689Z5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Sbno1Q689Z5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Sbno1Q689Z5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sbno1Q689Z5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Sbno1Q689Z5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Sbno1Q689Z5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Sbno1Q689Z5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Sbno1Q689Z5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Sbno1Q689Z5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Sbno1Q689Z5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sbno1Q689Z5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Sbno1Q689Z5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Sbno1Q689Z5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Sbno1Q689Z5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Sbno1Q689Z5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Sbno1Q689Z5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Sbno1Q689Z5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sbno1Q689Z5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Sbno1Q689Z5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Sbno1Q689Z5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Sbno1Q689Z5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Sbno1Q689Z5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Sbno1Q689Z5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sbno1Q689Z5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Sbno1Q689Z5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sbno1Q689Z5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sbno1Q689Z5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sbno1Q689Z5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sbno1Q689Z5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Sbno1Q689Z5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Sbno1Q689Z5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Sbno1Q689Z5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Sbno1Q689Z5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sbno1Q689Z5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Sbno1Q689Z5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Sbno1Q689Z5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Sbno1Q689Z5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sbno1Q689Z5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sbno1Q689Z5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Sbno1Q689Z5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sbno1Q689Z5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sbno1Q689Z5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sbno1Q689Z5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sbno1Q689Z5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sbno1Q689Z5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sbno1Q689Z5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sbno1Q689Z5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sbno1Q689Z5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sbno1Q689Z5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sbno1Q689Z5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Sbno1Q689Z5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sbno1Q689Z5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sbno1Q689Z5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Sbno1Q689Z5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Sbno1Q689Z5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sbno1Q689Z5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sbno1Q689Z5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sbno1Q689Z5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sbno1Q689Z5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sbno1Q689Z5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Sbno1Q689Z5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sbno1Q689Z5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sbno1Q689Z5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Sbno1Q689Z5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sbno1Q689Z5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Sbno1Q689Z5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Sbno1Q689Z5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sbno1Q689Z5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sbno1Q689Z5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sbno1Q689Z5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Sbno1Q689Z5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Sbno1Q689Z5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Sbno1Q689Z5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sbno1Q689Z5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Sbno1Q689Z5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms