Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clec4b2Q67DU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clec4b2Q67DU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Clec4b2Q67DU8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Clec4b2Q67DU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec4b2Q67DU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec4b2Q67DU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec4b2Q67DU8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec4b2Q67DU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clec4b2Q67DU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clec4b2Q67DU8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clec4b2Q67DU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms