Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Nlrp9bQ66X22 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Nlrp9bQ66X22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Nlrp9bQ66X22 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,75■■■□□ 2,83
Nlrp9bQ66X22 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Nlrp9bQ66X22 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Nlrp9bQ66X22 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Nlrp9bQ66X22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Nlrp9bQ66X22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Nlrp9bQ66X22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Nlrp9bQ66X22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Nlrp9bQ66X22 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Nlrp9bQ66X22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Nlrp9bQ66X22 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Nlrp9bQ66X22 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Nlrp9bQ66X22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Nlrp9bQ66X22 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Nlrp9bQ66X22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Nlrp9bQ66X22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Nlrp9bQ66X22 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Nlrp9bQ66X22 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Nlrp9bQ66X22 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,45■■■□□ 2,79
Nlrp9bQ66X22 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Nlrp9bQ66X22 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Nlrp9bQ66X22 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Nlrp9bQ66X22 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Nlrp9bQ66X22 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Nlrp9bQ66X22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Nlrp9bQ66X22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Nlrp9bQ66X22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Nlrp9bQ66X22 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Nlrp9bQ66X22 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Nlrp9bQ66X22 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Nlrp9bQ66X22 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Nlrp9bQ66X22 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Nlrp9bQ66X22 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Nlrp9bQ66X22 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Nlrp9bQ66X22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32,14■■■□□ 2,74
Nlrp9bQ66X22 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Nlrp9bQ66X22 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Nlrp9bQ66X22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Nlrp9bQ66X22 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Nlrp9bQ66X22 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Nlrp9bQ66X22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Nlrp9bQ66X22 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Nlrp9bQ66X22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Nlrp9bQ66X22 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Nlrp9bQ66X22 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Nlrp9bQ66X22 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Nlrp9bQ66X22 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
Nlrp9bQ66X22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Nlrp9bQ66X22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Nlrp9bQ66X22 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Nlrp9bQ66X22 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Nlrp9bQ66X22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Nlrp9bQ66X22 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Nlrp9bQ66X22 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Nlrp9bQ66X22 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Nlrp9bQ66X22 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Nlrp9bQ66X22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31,82■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nlrp9bQ66X22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Nlrp9bQ66X22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Nlrp9bQ66X22 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Nlrp9bQ66X22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Nlrp9bQ66X22 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,2 ms