Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20809Q62458 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm20809Q62458 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20809Q62458 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20809Q62458 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20809Q62458 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20809Q62458 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20809Q62458 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20809Q62458 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20809Q62458 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20809Q62458 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20809Q62458 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm20809Q62458 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20809Q62458 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm20809Q62458 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm20809Q62458 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm20809Q62458 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm20809Q62458 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm20809Q62458 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm20809Q62458 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20809Q62458 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20809Q62458 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20809Q62458 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms