Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3gl2Q62420 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3gl2Q62420 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3gl2Q62420 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3gl2Q62420 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3gl2Q62420 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3gl2Q62420 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3gl2Q62420 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3gl2Q62420 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3gl2Q62420 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3gl2Q62420 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3gl2Q62420 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3gl2Q62420 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3gl2Q62420 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3gl2Q62420 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3gl2Q62420 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sh3gl2Q62420 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3gl2Q62420 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3gl2Q62420 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3gl2Q62420 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3gl2Q62420 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3gl2Q62420 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3gl2Q62420 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3gl2Q62420 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sh3gl2Q62420 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3gl2Q62420 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3gl2Q62420 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3gl2Q62420 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3gl2Q62420 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3gl2Q62420 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3gl2Q62420 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3gl2Q62420 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3gl2Q62420 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3gl2Q62420 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3gl2Q62420 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3gl2Q62420 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3gl2Q62420 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3gl2Q62420 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3gl2Q62420 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sh3gl2Q62420 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3gl2Q62420 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sh3gl2Q62420 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sh3gl2Q62420 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3gl2Q62420 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3gl2Q62420 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3gl2Q62420 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3gl2Q62420 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms