Protein–RNA interactions for Protein: Q62313

Tgoln1, Trans-Golgi network integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgoln1Q62313 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgoln1Q62313 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tgoln1Q62313 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgoln1Q62313 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgoln1Q62313 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgoln1Q62313 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgoln1Q62313 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgoln1Q62313 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgoln1Q62313 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgoln1Q62313 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgoln1Q62313 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgoln1Q62313 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgoln1Q62313 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgoln1Q62313 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgoln1Q62313 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgoln1Q62313 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgoln1Q62313 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgoln1Q62313 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgoln1Q62313 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgoln1Q62313 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgoln1Q62313 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgoln1Q62313 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgoln1Q62313 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgoln1Q62313 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgoln1Q62313 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgoln1Q62313 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms