Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,58■■□□□ 1,53
AtrxQ61687 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
AtrxQ61687 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
AtrxQ61687 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
AtrxQ61687 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
AtrxQ61687 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
AtrxQ61687 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
AtrxQ61687 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
AtrxQ61687 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,5
AtrxQ61687 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
AtrxQ61687 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
AtrxQ61687 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,4■■□□□ 1,5
AtrxQ61687 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,4■■□□□ 1,5
AtrxQ61687 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24,33■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
AtrxQ61687 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
AtrxQ61687 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
AtrxQ61687 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
AtrxQ61687 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
AtrxQ61687 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,28■■□□□ 1,48
AtrxQ61687 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,25■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
AtrxQ61687 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24,15■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
AtrxQ61687 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
AtrxQ61687 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
AtrxQ61687 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
AtrxQ61687 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
AtrxQ61687 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
AtrxQ61687 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,94■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
AtrxQ61687 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,86■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
AtrxQ61687 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
AtrxQ61687 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
AtrxQ61687 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
AtrxQ61687 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
AtrxQ61687 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,68■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23,67■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,66■■□□□ 1,38
AtrxQ61687 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,65■■□□□ 1,38
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