Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AtrxQ61687 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtrxQ61687 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtrxQ61687 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtrxQ61687 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtrxQ61687 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtrxQ61687 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtrxQ61687 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AtrxQ61687 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AtrxQ61687 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AtrxQ61687 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AtrxQ61687 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AtrxQ61687 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AtrxQ61687 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrxQ61687 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AtrxQ61687 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AtrxQ61687 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AtrxQ61687 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AtrxQ61687 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtrxQ61687 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AtrxQ61687 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AtrxQ61687 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AtrxQ61687 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AtrxQ61687 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AtrxQ61687 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AtrxQ61687 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AtrxQ61687 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AtrxQ61687 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AtrxQ61687 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AtrxQ61687 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AtrxQ61687 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AtrxQ61687 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AtrxQ61687 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AtrxQ61687 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AtrxQ61687 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AtrxQ61687 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms