Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim25Q61510 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim25Q61510 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trim25Q61510 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trim25Q61510 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trim25Q61510 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trim25Q61510 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim25Q61510 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trim25Q61510 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim25Q61510 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim25Q61510 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim25Q61510 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim25Q61510 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim25Q61510 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim25Q61510 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim25Q61510 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim25Q61510 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim25Q61510 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim25Q61510 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim25Q61510 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim25Q61510 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim25Q61510 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim25Q61510 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim25Q61510 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim25Q61510 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim25Q61510 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim25Q61510 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim25Q61510 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms