Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sox17Q61473 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox17Q61473 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox17Q61473 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sox17Q61473 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sox17Q61473 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox17Q61473 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox17Q61473 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox17Q61473 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox17Q61473 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox17Q61473 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sox17Q61473 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sox17Q61473 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sox17Q61473 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sox17Q61473 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sox17Q61473 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sox17Q61473 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sox17Q61473 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms