Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Snta1Q61234 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snta1Q61234 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snta1Q61234 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snta1Q61234 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snta1Q61234 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snta1Q61234 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snta1Q61234 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snta1Q61234 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snta1Q61234 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snta1Q61234 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snta1Q61234 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snta1Q61234 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snta1Q61234 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snta1Q61234 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snta1Q61234 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snta1Q61234 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snta1Q61234 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snta1Q61234 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snta1Q61234 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Snta1Q61234 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms