Protein–RNA interactions for Protein: Q61147

Cp, Ceruloplasmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpQ61147 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CpQ61147 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CpQ61147 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CpQ61147 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CpQ61147 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CpQ61147 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CpQ61147 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CpQ61147 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CpQ61147 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CpQ61147 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CpQ61147 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CpQ61147 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CpQ61147 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CpQ61147 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CpQ61147 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CpQ61147 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CpQ61147 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CpQ61147 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CpQ61147 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpQ61147 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpQ61147 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CpQ61147 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CpQ61147 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CpQ61147 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CpQ61147 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CpQ61147 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpQ61147 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CpQ61147 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CpQ61147 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CpQ61147 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CpQ61147 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CpQ61147 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CpQ61147 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CpQ61147 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CpQ61147 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CpQ61147 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CpQ61147 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CpQ61147 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CpQ61147 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CpQ61147 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CpQ61147 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CpQ61147 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CpQ61147 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CpQ61147 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CpQ61147 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CpQ61147 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CpQ61147 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CpQ61147 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CpQ61147 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CpQ61147 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CpQ61147 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CpQ61147 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CpQ61147 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CpQ61147 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CpQ61147 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CpQ61147 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CpQ61147 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CpQ61147 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CpQ61147 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CpQ61147 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CpQ61147 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CpQ61147 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CpQ61147 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CpQ61147 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CpQ61147 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CpQ61147 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CpQ61147 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CpQ61147 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CpQ61147 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CpQ61147 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CpQ61147 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CpQ61147 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CpQ61147 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CpQ61147 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CpQ61147 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CpQ61147 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CpQ61147 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CpQ61147 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CpQ61147 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CpQ61147 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CpQ61147 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CpQ61147 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CpQ61147 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CpQ61147 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CpQ61147 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CpQ61147 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CpQ61147 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CpQ61147 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CpQ61147 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CpQ61147 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CpQ61147 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CpQ61147 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CpQ61147 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CpQ61147 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CpQ61147 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CpQ61147 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CpQ61147 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CpQ61147 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CpQ61147 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CpQ61147 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 648.5 ms