Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxf1Q61080 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxf1Q61080 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxf1Q61080 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxf1Q61080 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxf1Q61080 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Foxf1Q61080 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxf1Q61080 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Foxf1Q61080 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxf1Q61080 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Foxf1Q61080 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxf1Q61080 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxf1Q61080 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxf1Q61080 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxf1Q61080 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms