Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
HellsQ60848 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
HellsQ60848 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
HellsQ60848 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
HellsQ60848 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
HellsQ60848 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
HellsQ60848 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
HellsQ60848 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,05■■■□□ 2,88
HellsQ60848 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
HellsQ60848 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
HellsQ60848 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,01■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
HellsQ60848 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
HellsQ60848 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
HellsQ60848 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
HellsQ60848 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
HellsQ60848 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
HellsQ60848 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
HellsQ60848 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
HellsQ60848 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
HellsQ60848 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,83■■■□□ 2,85
HellsQ60848 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
HellsQ60848 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
HellsQ60848 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
HellsQ60848 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
HellsQ60848 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
HellsQ60848 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
HellsQ60848 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
HellsQ60848 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,75■■■□□ 2,83
HellsQ60848 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
HellsQ60848 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
HellsQ60848 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
HellsQ60848 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
HellsQ60848 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,7■■■□□ 2,83
HellsQ60848 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
HellsQ60848 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
HellsQ60848 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
HellsQ60848 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
HellsQ60848 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32,61■■■□□ 2,81
HellsQ60848 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,6■■■□□ 2,81
HellsQ60848 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
HellsQ60848 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
HellsQ60848 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,54■■■□□ 2,8
HellsQ60848 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
HellsQ60848 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,48■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32,48■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
HellsQ60848 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,45■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
HellsQ60848 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,43■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
HellsQ60848 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
HellsQ60848 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32,41■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
HellsQ60848 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
HellsQ60848 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
HellsQ60848 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
HellsQ60848 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
HellsQ60848 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
HellsQ60848 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
HellsQ60848 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
HellsQ60848 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
HellsQ60848 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
HellsQ60848 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
HellsQ60848 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
HellsQ60848 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,76
HellsQ60848 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,26■■■□□ 2,76
HellsQ60848 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
HellsQ60848 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
HellsQ60848 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,74
HellsQ60848 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
HellsQ60848 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
HellsQ60848 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
HellsQ60848 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
HellsQ60848 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
HellsQ60848 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
HellsQ60848 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
HellsQ60848 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms