Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb6Q60692 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb6Q60692 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psmb6Q60692 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psmb6Q60692 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psmb6Q60692 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb6Q60692 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psmb6Q60692 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb6Q60692 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psmb6Q60692 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psmb6Q60692 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb6Q60692 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb6Q60692 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb6Q60692 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb6Q60692 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psmb6Q60692 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms