Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmo1Q5SXG7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmo1Q5SXG7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmo1Q5SXG7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmo1Q5SXG7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmo1Q5SXG7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmo1Q5SXG7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmo1Q5SXG7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmo1Q5SXG7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmo1Q5SXG7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmo1Q5SXG7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmo1Q5SXG7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmo1Q5SXG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmo1Q5SXG7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmo1Q5SXG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmo1Q5SXG7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmo1Q5SXG7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmo1Q5SXG7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmo1Q5SXG7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmo1Q5SXG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms