Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc1Q5NCF2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc1Q5NCF2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc1Q5NCF2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc1Q5NCF2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc1Q5NCF2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc1Q5NCF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc1Q5NCF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms