Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce1lQ5D525 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1lQ5D525 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syce1lQ5D525 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1lQ5D525 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce1lQ5D525 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce1lQ5D525 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce1lQ5D525 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce1lQ5D525 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce1lQ5D525 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce1lQ5D525 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce1lQ5D525 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1lQ5D525 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1lQ5D525 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce1lQ5D525 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syce1lQ5D525 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce1lQ5D525 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce1lQ5D525 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syce1lQ5D525 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1lQ5D525 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce1lQ5D525 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syce1lQ5D525 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syce1lQ5D525 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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