Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdp2Q504M2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdp2Q504M2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdp2Q504M2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdp2Q504M2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdp2Q504M2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdp2Q504M2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdp2Q504M2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdp2Q504M2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdp2Q504M2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdp2Q504M2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdp2Q504M2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdp2Q504M2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdp2Q504M2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdp2Q504M2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdp2Q504M2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdp2Q504M2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdp2Q504M2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdp2Q504M2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdp2Q504M2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pdp2Q504M2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdp2Q504M2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdp2Q504M2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdp2Q504M2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdp2Q504M2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdp2Q504M2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdp2Q504M2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdp2Q504M2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdp2Q504M2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdp2Q504M2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdp2Q504M2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdp2Q504M2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdp2Q504M2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdp2Q504M2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms