Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Carmil2Q3V3V9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Carmil2Q3V3V9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Carmil2Q3V3V9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Carmil2Q3V3V9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Carmil2Q3V3V9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Carmil2Q3V3V9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Carmil2Q3V3V9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Carmil2Q3V3V9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Carmil2Q3V3V9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Carmil2Q3V3V9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Carmil2Q3V3V9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Carmil2Q3V3V9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Carmil2Q3V3V9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Carmil2Q3V3V9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Carmil2Q3V3V9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Carmil2Q3V3V9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Carmil2Q3V3V9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Carmil2Q3V3V9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Carmil2Q3V3V9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Carmil2Q3V3V9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Carmil2Q3V3V9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Carmil2Q3V3V9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Carmil2Q3V3V9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Carmil2Q3V3V9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil2Q3V3V9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Carmil2Q3V3V9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Carmil2Q3V3V9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil2Q3V3V9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Carmil2Q3V3V9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Carmil2Q3V3V9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil2Q3V3V9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Carmil2Q3V3V9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Carmil2Q3V3V9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Carmil2Q3V3V9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil2Q3V3V9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Carmil2Q3V3V9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Carmil2Q3V3V9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Carmil2Q3V3V9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Carmil2Q3V3V9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Carmil2Q3V3V9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Carmil2Q3V3V9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Carmil2Q3V3V9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Carmil2Q3V3V9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms