Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1N9

A3galt2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3galt2Q3V1N9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A3galt2Q3V1N9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3galt2Q3V1N9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms