Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc110Q3V125 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc110Q3V125 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc110Q3V125 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc110Q3V125 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc110Q3V125 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc110Q3V125 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc110Q3V125 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc110Q3V125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc110Q3V125 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc110Q3V125 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc110Q3V125 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc110Q3V125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc110Q3V125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc110Q3V125 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc110Q3V125 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc110Q3V125 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc110Q3V125 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc110Q3V125 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc110Q3V125 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc110Q3V125 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc110Q3V125 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc110Q3V125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc110Q3V125 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc110Q3V125 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc110Q3V125 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc110Q3V125 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc110Q3V125 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc110Q3V125 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc110Q3V125 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc110Q3V125 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc110Q3V125 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc110Q3V125 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc110Q3V125 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc110Q3V125 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc110Q3V125 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc110Q3V125 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc110Q3V125 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc110Q3V125 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc110Q3V125 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc110Q3V125 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc110Q3V125 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc110Q3V125 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc110Q3V125 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms