Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms