Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syndig1lQ3USQ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syndig1lQ3USQ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syndig1lQ3USQ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syndig1lQ3USQ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syndig1lQ3USQ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syndig1lQ3USQ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syndig1lQ3USQ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syndig1lQ3USQ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syndig1lQ3USQ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syndig1lQ3USQ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syndig1lQ3USQ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syndig1lQ3USQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syndig1lQ3USQ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syndig1lQ3USQ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syndig1lQ3USQ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syndig1lQ3USQ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syndig1lQ3USQ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syndig1lQ3USQ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syndig1lQ3USQ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syndig1lQ3USQ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syndig1lQ3USQ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syndig1lQ3USQ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syndig1lQ3USQ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syndig1lQ3USQ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syndig1lQ3USQ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syndig1lQ3USQ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syndig1lQ3USQ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syndig1lQ3USQ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms