Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hdgfl2Q3UMU9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdgfl2Q3UMU9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdgfl2Q3UMU9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdgfl2Q3UMU9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdgfl2Q3UMU9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdgfl2Q3UMU9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdgfl2Q3UMU9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdgfl2Q3UMU9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdgfl2Q3UMU9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdgfl2Q3UMU9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdgfl2Q3UMU9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdgfl2Q3UMU9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdgfl2Q3UMU9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdgfl2Q3UMU9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdgfl2Q3UMU9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdgfl2Q3UMU9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdgfl2Q3UMU9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdgfl2Q3UMU9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdgfl2Q3UMU9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdgfl2Q3UMU9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdgfl2Q3UMU9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdgfl2Q3UMU9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdgfl2Q3UMU9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms