Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mcrip1Q3UGS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mcrip1Q3UGS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mcrip1Q3UGS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mcrip1Q3UGS4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mcrip1Q3UGS4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mcrip1Q3UGS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mcrip1Q3UGS4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mcrip1Q3UGS4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mcrip1Q3UGS4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mcrip1Q3UGS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mcrip1Q3UGS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mcrip1Q3UGS4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mcrip1Q3UGS4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcrip1Q3UGS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcrip1Q3UGS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms