Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kdm4dQ3U2K5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kdm4dQ3U2K5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4dQ3U2K5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4dQ3U2K5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4dQ3U2K5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4dQ3U2K5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4dQ3U2K5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm4dQ3U2K5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm4dQ3U2K5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm4dQ3U2K5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kdm4dQ3U2K5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kdm4dQ3U2K5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kdm4dQ3U2K5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kdm4dQ3U2K5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kdm4dQ3U2K5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kdm4dQ3U2K5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kdm4dQ3U2K5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4dQ3U2K5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm4dQ3U2K5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4dQ3U2K5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm4dQ3U2K5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm4dQ3U2K5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4dQ3U2K5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms