Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfyve27Q3TXX3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfyve27Q3TXX3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfyve27Q3TXX3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfyve27Q3TXX3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfyve27Q3TXX3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfyve27Q3TXX3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfyve27Q3TXX3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfyve27Q3TXX3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfyve27Q3TXX3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfyve27Q3TXX3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfyve27Q3TXX3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfyve27Q3TXX3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfyve27Q3TXX3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zfyve27Q3TXX3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfyve27Q3TXX3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfyve27Q3TXX3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfyve27Q3TXX3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfyve27Q3TXX3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfyve27Q3TXX3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfyve27Q3TXX3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfyve27Q3TXX3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfyve27Q3TXX3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfyve27Q3TXX3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfyve27Q3TXX3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfyve27Q3TXX3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfyve27Q3TXX3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfyve27Q3TXX3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfyve27Q3TXX3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfyve27Q3TXX3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfyve27Q3TXX3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfyve27Q3TXX3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfyve27Q3TXX3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zfyve27Q3TXX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms