Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdx4Q07424 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdx4Q07424 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdx4Q07424 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cdx4Q07424 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cdx4Q07424 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdx4Q07424 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdx4Q07424 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdx4Q07424 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdx4Q07424 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdx4Q07424 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdx4Q07424 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdx4Q07424 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdx4Q07424 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms