Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Emx1Q04742 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Emx1Q04742 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Emx1Q04742 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Emx1Q04742 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Emx1Q04742 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Emx1Q04742 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Emx1Q04742 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Emx1Q04742 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emx1Q04742 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emx1Q04742 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emx1Q04742 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Emx1Q04742 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Emx1Q04742 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Emx1Q04742 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Emx1Q04742 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Emx1Q04742 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Emx1Q04742 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Emx1Q04742 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Emx1Q04742 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Emx1Q04742 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emx1Q04742 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Emx1Q04742 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Emx1Q04742 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Emx1Q04742 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Emx1Q04742 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Emx1Q04742 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Emx1Q04742 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms