Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Kcnd1Q03719 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Kcnd1Q03719 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Kcnd1Q03719 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Kcnd1Q03719 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Kcnd1Q03719 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,39■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Kcnd1Q03719 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Kcnd1Q03719 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Kcnd1Q03719 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Kcnd1Q03719 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Kcnd1Q03719 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Kcnd1Q03719 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Kcnd1Q03719 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Kcnd1Q03719 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Kcnd1Q03719 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Kcnd1Q03719 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Kcnd1Q03719 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Kcnd1Q03719 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Kcnd1Q03719 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Kcnd1Q03719 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Kcnd1Q03719 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Kcnd1Q03719 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Kcnd1Q03719 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Kcnd1Q03719 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Kcnd1Q03719 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27,95■■■□□ 2,07
Kcnd1Q03719 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Kcnd1Q03719 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Kcnd1Q03719 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Kcnd1Q03719 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Kcnd1Q03719 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Kcnd1Q03719 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Kcnd1Q03719 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Kcnd1Q03719 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Kcnd1Q03719 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Kcnd1Q03719 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Kcnd1Q03719 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Kcnd1Q03719 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Kcnd1Q03719 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Kcnd1Q03719 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,8 ms