Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx2Q03358 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msx2Q03358 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msx2Q03358 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msx2Q03358 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Msx2Q03358 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msx2Q03358 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msx2Q03358 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msx2Q03358 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Msx2Q03358 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msx2Q03358 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msx2Q03358 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msx2Q03358 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msx2Q03358 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msx2Q03358 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Msx2Q03358 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msx2Q03358 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Msx2Q03358 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msx2Q03358 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Msx2Q03358 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msx2Q03358 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msx2Q03358 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msx2Q03358 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Msx2Q03358 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msx2Q03358 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msx2Q03358 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msx2Q03358 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msx2Q03358 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msx2Q03358 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msx2Q03358 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms