Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VcpQ01853 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VcpQ01853 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VcpQ01853 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VcpQ01853 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VcpQ01853 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VcpQ01853 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VcpQ01853 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VcpQ01853 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VcpQ01853 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VcpQ01853 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VcpQ01853 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VcpQ01853 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VcpQ01853 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VcpQ01853 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VcpQ01853 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VcpQ01853 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VcpQ01853 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VcpQ01853 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VcpQ01853 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VcpQ01853 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VcpQ01853 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VcpQ01853 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VcpQ01853 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VcpQ01853 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VcpQ01853 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VcpQ01853 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VcpQ01853 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VcpQ01853 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VcpQ01853 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VcpQ01853 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VcpQ01853 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VcpQ01853 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VcpQ01853 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VcpQ01853 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VcpQ01853 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VcpQ01853 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VcpQ01853 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VcpQ01853 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VcpQ01853 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VcpQ01853 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VcpQ01853 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VcpQ01853 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VcpQ01853 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VcpQ01853 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VcpQ01853 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VcpQ01853 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VcpQ01853 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VcpQ01853 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VcpQ01853 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VcpQ01853 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VcpQ01853 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VcpQ01853 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VcpQ01853 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VcpQ01853 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VcpQ01853 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VcpQ01853 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VcpQ01853 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VcpQ01853 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VcpQ01853 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VcpQ01853 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VcpQ01853 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VcpQ01853 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VcpQ01853 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VcpQ01853 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VcpQ01853 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VcpQ01853 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VcpQ01853 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VcpQ01853 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VcpQ01853 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VcpQ01853 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VcpQ01853 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms