Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp4Q00724 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp4Q00724 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rbp4Q00724 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rbp4Q00724 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp4Q00724 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rbp4Q00724 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbp4Q00724 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbp4Q00724 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbp4Q00724 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbp4Q00724 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp4Q00724 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp4Q00724 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp4Q00724 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp4Q00724 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp4Q00724 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp4Q00724 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp4Q00724 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp4Q00724 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp4Q00724 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp4Q00724 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp4Q00724 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp4Q00724 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp4Q00724 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp4Q00724 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms