Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gata5P97489 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gata5P97489 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gata5P97489 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gata5P97489 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gata5P97489 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gata5P97489 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gata5P97489 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gata5P97489 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gata5P97489 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gata5P97489 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gata5P97489 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gata5P97489 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gata5P97489 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gata5P97489 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gata5P97489 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gata5P97489 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gata5P97489 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gata5P97489 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gata5P97489 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gata5P97489 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gata5P97489 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gata5P97489 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gata5P97489 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gata5P97489 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gata5P97489 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gata5P97489 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gata5P97489 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gata5P97489 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms