Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx3-1P97436 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx3-1P97436 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx3-1P97436 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx3-1P97436 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx3-1P97436 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx3-1P97436 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx3-1P97436 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx3-1P97436 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx3-1P97436 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx3-1P97436 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx3-1P97436 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx3-1P97436 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx3-1P97436 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx3-1P97436 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx3-1P97436 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx3-1P97436 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx3-1P97436 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx3-1P97436 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx3-1P97436 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx3-1P97436 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx3-1P97436 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx3-1P97436 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx3-1P97436 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx3-1P97436 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx3-1P97436 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx3-1P97436 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx3-1P97436 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx3-1P97436 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx3-1P97436 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nkx3-1P97436 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx3-1P97436 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx3-1P97436 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx3-1P97436 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx3-1P97436 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms