Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dlx4P70436 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dlx4P70436 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dlx4P70436 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dlx4P70436 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dlx4P70436 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dlx4P70436 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dlx4P70436 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Dlx4P70436 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dlx4P70436 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dlx4P70436 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dlx4P70436 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dlx4P70436 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dlx4P70436 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dlx4P70436 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dlx4P70436 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dlx4P70436 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dlx4P70436 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dlx4P70436 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dlx4P70436 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dlx4P70436 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dlx4P70436 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dlx4P70436 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dlx4P70436 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dlx4P70436 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms