Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc8a1P70414 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc8a1P70414 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc8a1P70414 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc8a1P70414 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc8a1P70414 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc8a1P70414 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc8a1P70414 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc8a1P70414 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc8a1P70414 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc8a1P70414 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slc8a1P70414 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc8a1P70414 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc8a1P70414 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc8a1P70414 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc8a1P70414 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc8a1P70414 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc8a1P70414 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc8a1P70414 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc8a1P70414 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc8a1P70414 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc8a1P70414 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc8a1P70414 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc8a1P70414 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc8a1P70414 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc8a1P70414 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc8a1P70414 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc8a1P70414 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc8a1P70414 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc8a1P70414 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc8a1P70414 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc8a1P70414 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc8a1P70414 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms