Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ufd1P70362 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ufd1P70362 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufd1P70362 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufd1P70362 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufd1P70362 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufd1P70362 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufd1P70362 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ufd1P70362 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufd1P70362 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ufd1P70362 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ufd1P70362 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ufd1P70362 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ufd1P70362 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ufd1P70362 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufd1P70362 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufd1P70362 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms