Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac2P70288 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hdac2P70288 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac2P70288 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdac2P70288 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdac2P70288 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hdac2P70288 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hdac2P70288 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hdac2P70288 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hdac2P70288 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac2P70288 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac2P70288 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac2P70288 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac2P70288 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac2P70288 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdac2P70288 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac2P70288 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac2P70288 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac2P70288 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac2P70288 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms