Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tuba1cP68373 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba1cP68373 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba1cP68373 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tuba1cP68373 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tuba1cP68373 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tuba1cP68373 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tuba1cP68373 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tuba1cP68373 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tuba1cP68373 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tuba1cP68373 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba1cP68373 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba1cP68373 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tuba1cP68373 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba1cP68373 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba1cP68373 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tuba1cP68373 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba1cP68373 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tuba1cP68373 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tuba1cP68373 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba1cP68373 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba1cP68373 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tuba1cP68373 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tuba1cP68373 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tuba1cP68373 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba1cP68373 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms