Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tuba4aP68368 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba4aP68368 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba4aP68368 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tuba4aP68368 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tuba4aP68368 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tuba4aP68368 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tuba4aP68368 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba4aP68368 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba4aP68368 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba4aP68368 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tuba4aP68368 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba4aP68368 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tuba4aP68368 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tuba4aP68368 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tuba4aP68368 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tuba4aP68368 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tuba4aP68368 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tuba4aP68368 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tuba4aP68368 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms