Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vsnl1P62761 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vsnl1P62761 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vsnl1P62761 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vsnl1P62761 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vsnl1P62761 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vsnl1P62761 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vsnl1P62761 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vsnl1P62761 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vsnl1P62761 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vsnl1P62761 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vsnl1P62761 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vsnl1P62761 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vsnl1P62761 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vsnl1P62761 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Vsnl1P62761 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vsnl1P62761 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vsnl1P62761 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vsnl1P62761 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vsnl1P62761 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vsnl1P62761 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vsnl1P62761 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vsnl1P62761 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vsnl1P62761 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vsnl1P62761 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vsnl1P62761 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vsnl1P62761 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vsnl1P62761 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vsnl1P62761 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vsnl1P62761 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vsnl1P62761 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vsnl1P62761 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vsnl1P62761 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vsnl1P62761 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vsnl1P62761 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vsnl1P62761 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vsnl1P62761 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms