Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps11P62281 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps11P62281 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps11P62281 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps11P62281 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps11P62281 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps11P62281 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps11P62281 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps11P62281 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps11P62281 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps11P62281 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps11P62281 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps11P62281 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps11P62281 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps11P62281 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps11P62281 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps11P62281 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps11P62281 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps11P62281 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps11P62281 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps11P62281 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps11P62281 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps11P62281 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps11P62281 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps11P62281 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps11P62281 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps11P62281 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps11P62281 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps11P62281 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps11P62281 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms