Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan5P62080 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan5P62080 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan5P62080 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan5P62080 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan5P62080 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan5P62080 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan5P62080 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan5P62080 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan5P62080 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tspan5P62080 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tspan5P62080 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan5P62080 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan5P62080 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan5P62080 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms