Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
SnnP61807 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
SnnP61807 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
SnnP61807 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,7■■□□□ 1,71
SnnP61807 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
SnnP61807 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
SnnP61807 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
SnnP61807 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SnnP61807 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SnnP61807 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
SnnP61807 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
SnnP61807 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
SnnP61807 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
SnnP61807 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
SnnP61807 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
SnnP61807 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
SnnP61807 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
SnnP61807 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
SnnP61807 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SnnP61807 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SnnP61807 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SnnP61807 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SnnP61807 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SnnP61807 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
SnnP61807 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SnnP61807 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
SnnP61807 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
SnnP61807 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
SnnP61807 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
SnnP61807 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
SnnP61807 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SnnP61807 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SnnP61807 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SnnP61807 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
SnnP61807 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
SnnP61807 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SnnP61807 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SnnP61807 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
SnnP61807 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SnnP61807 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SnnP61807 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
SnnP61807 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
SnnP61807 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
SnnP61807 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
SnnP61807 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
SnnP61807 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
SnnP61807 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
SnnP61807 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
SnnP61807 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
SnnP61807 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SnnP61807 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SnnP61807 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
SnnP61807 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
SnnP61807 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
SnnP61807 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
SnnP61807 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
SnnP61807 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
SnnP61807 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
SnnP61807 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,35■■□□□ 1,65
SnnP61807 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
SnnP61807 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
SnnP61807 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
SnnP61807 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
SnnP61807 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
SnnP61807 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
SnnP61807 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,25■■□□□ 1,63
SnnP61807 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
SnnP61807 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
SnnP61807 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
SnnP61807 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
SnnP61807 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
SnnP61807 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
SnnP61807 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
SnnP61807 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
SnnP61807 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
SnnP61807 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
SnnP61807 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
SnnP61807 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
SnnP61807 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
SnnP61807 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
SnnP61807 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
SnnP61807 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
SnnP61807 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
SnnP61807 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
SnnP61807 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
SnnP61807 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
SnnP61807 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
SnnP61807 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
SnnP61807 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
SnnP61807 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
SnnP61807 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
SnnP61807 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
SnnP61807 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
SnnP61807 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
SnnP61807 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
SnnP61807 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
SnnP61807 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
SnnP61807 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
SnnP61807 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
SnnP61807 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms