Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx1bP61264 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx1bP61264 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx1bP61264 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx1bP61264 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx1bP61264 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx1bP61264 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx1bP61264 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx1bP61264 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1bP61264 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx1bP61264 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx1bP61264 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx1bP61264 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx1bP61264 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stx1bP61264 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1bP61264 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stx1bP61264 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stx1bP61264 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stx1bP61264 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stx1bP61264 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms