Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b6P59708 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b6P59708 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b6P59708 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b6P59708 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf3b6P59708 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf3b6P59708 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b6P59708 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b6P59708 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b6P59708 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b6P59708 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b6P59708 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b6P59708 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b6P59708 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b6P59708 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b6P59708 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b6P59708 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b6P59708 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms