Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Senp1P59110 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp1P59110 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Senp1P59110 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Senp1P59110 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp1P59110 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Senp1P59110 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Senp1P59110 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp1P59110 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Senp1P59110 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Senp1P59110 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp1P59110 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp1P59110 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp1P59110 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp1P59110 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp1P59110 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp1P59110 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp1P59110 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp1P59110 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Senp1P59110 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp1P59110 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp1P59110 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp1P59110 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Senp1P59110 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Senp1P59110 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Senp1P59110 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Senp1P59110 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Senp1P59110 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp1P59110 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp1P59110 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Senp1P59110 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Senp1P59110 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Senp1P59110 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Senp1P59110 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Senp1P59110 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Senp1P59110 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Senp1P59110 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Senp1P59110 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Senp1P59110 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Senp1P59110 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Senp1P59110 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Senp1P59110 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Senp1P59110 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms