Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Paxbp1P58501 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Paxbp1P58501 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Paxbp1P58501 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Paxbp1P58501 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Paxbp1P58501 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Paxbp1P58501 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Paxbp1P58501 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Paxbp1P58501 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Paxbp1P58501 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Paxbp1P58501 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Paxbp1P58501 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Paxbp1P58501 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Paxbp1P58501 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Paxbp1P58501 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Paxbp1P58501 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Paxbp1P58501 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Paxbp1P58501 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Paxbp1P58501 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Paxbp1P58501 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Paxbp1P58501 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Paxbp1P58501 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Paxbp1P58501 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Paxbp1P58501 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Paxbp1P58501 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Paxbp1P58501 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Paxbp1P58501 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Paxbp1P58501 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Paxbp1P58501 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Paxbp1P58501 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Paxbp1P58501 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Paxbp1P58501 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Paxbp1P58501 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Paxbp1P58501 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Paxbp1P58501 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Paxbp1P58501 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Paxbp1P58501 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Paxbp1P58501 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Paxbp1P58501 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Paxbp1P58501 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Paxbp1P58501 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Paxbp1P58501 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Paxbp1P58501 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,5 ms